Ein Merkmal der High Throughput Analyse von 2D-Gelelektrophoreseexperimenten ist die Trennung von Analyse und Visualisierung. Es wird eine vollautomatische Analyseumgebung vorgestellt, in der die Visualisierung zur Kontrolle der Analyseergebnisse auf unterschiedlichen Abstraktionsebenen eingesetzt wird. Als Da- tenstruktur zur Experimentbeschreibung und Analyse dient XML.